En las páginas que están en producción es conveniente minimizar el código JavaScript y el CSS para que pesen menos y ayuden a que la velocidad de carga de la página sea rápida. Si bien los navegadores cachean estos ficheros y esto solamente se aplica a la primera carga siempre conviene que sea lo más rápida posible (además de reducir el ancho de banda que consumimos en nuestro servidor).
Hay muchos minimizadores de código JavaScript y de CSS, yo uso JavaScript Minifier simplemente porque tiene un enlace en la misma página a su minimizador de CSS, y hace todo el proceso más rápido.